公司補助員工健康檢查，費用到底要列「薪資支出」還是「職工福利」？需不需要扣繳申報？這是許多企業主與會計人員在實務上常遇到的問題，處理不當很容易引發稅務爭議。
近年來，ESG（環境、社會、治理）理念逐漸成為企業經營的核心指標，愈來愈多企業主動提供員工健康檢查補助，視為落實社會責任與員工關懷的重要措施。然而在稅務實務上，健檢支出的列帳方式，會因「法定健檢」與「非法定健檢」的不同而有所差異，補助方式不同也會影響扣繳申報的處理。
本文依據《職業安全衛生法》、《所得稅法》及《營利事業所得稅查核準則》，整理三種常見補助方式的列帳科目與扣繳申報實務，協助企業主與會計人員正確操作。
一、法定健檢 vs. 非法定健檢：職安法如何定義員工健檢範圍？
1.法定健檢的依據：職業安全衛生法與勞工健康保護規則
職業安全衛生法第20條
雇主於僱用勞工時，應施行體格檢查；對在職勞工應施行下列健康檢查：
一、一般健康檢查。
二、從事特別危害健康作業者之特殊健康檢查。
三、經中央主管機關指定為特定對象及特定項目之健康檢查。
前項檢查應由中央主管機關會商中央衛生主管機關認可之醫療機構之醫師為之；檢查紀錄雇主應予保存，並負擔健康檢查費用。
勞工健康保護規則第17條
雇主對在職勞工，應依下列規定，定期實施一般健康檢查：
一、年滿 65 歲者，每年檢查 1 次。
二、40 歲以上未滿 65 歲者，每 3 年檢查 1 次。
三、未滿 40 歲者，每 5 年檢查 1 次。
前項所定一般健康檢查之項目與檢查紀錄，應依前條附表九及附表十一規定辦理。但經檢查為先天性辨色力異常者，得免再實施辨色力檢查。
從上面內容我們可以得知，法定健檢大致包括三類：
- 「僱用時」的體格檢查（A）
- 「在職」勞工的一般健康檢查（B），以及
- 從事特別危害健康作業者之特殊健康檢查（C）
2.非法定健檢是什麼？超出職安法範圍的健檢補助
本文所謂非法定健檢，指的是
💡註：法定健檢與非法定健檢是本文自行創造的用語，主要目的是希望能幫助大家理解與記憶。
二、員工健康檢查費用怎麼列帳？是薪資所得還是職工福利？
1.僱用時的體格檢查（A）：列薪資支出，計入員工所得
公司於僱用員工時，對於員工應施行「體格檢查」所負擔之費用，屬於勞工職務上取得之補助費，是員工的薪資所得。
公司列報費用科目為「薪資支出」。
2.在職定期健檢（B）與特殊健檢（C）：列職工福利，免計員工所得
公司若依照職業安全衛生法第20條規定，對於在職勞工應施行之定期健康檢查，及對於從事特別危害健康之作業者，應定期施行特定項目之健康檢查，公司負擔之健康檢查費，可適用《營利事業所得稅查核準則》第 81 條第 5 款及第 8 款規定核實認定，列為「職工福利–員工醫療費」，免視為勞工之薪資所得。
3.非法定健檢：列薪資支出，須計入員工所得
不是基於職業安全衛生法規定，而是員工自公司支領或給付之其他健康檢查費用，屬於勞工職務上取得之補助費，是員工的薪資所得。
公司列報費用科目為「薪資支出」。
| 依據 | 項目 | 公司列報費用科目 | 應否列入員工所得 |
| 職業安全衛生法規定（法定健檢） | A.體格檢查 | 薪資支出 | 是（50薪資） |
| B.定期健康檢查 | 職工福利–員工醫療費 | 否 | |
| C.特定項目之健康檢查 | 職工福利–員工醫療費 | 否 | |
| 非職業安全衛生法規定（非法定健檢） | 健康檢查 | 薪資支出 | 是（50薪資） |
三、三種員工健康檢查補助方式的列帳與扣繳申報比較
企業補助員工健檢常見三種方式，分別為：
- 公司直接付款給健檢機構（醫療院所）
- 員工先自費，再檢據報銷
- 直接給予員工現金補助或津貼
其中第一種，公司直接付款給健檢機構（醫療院所），又區分公立醫院、財團（或社團）法人醫院、一般醫院與醫事檢驗所與診所，其扣繳處理彙整如下表。
由上表可知，公司補助員工健康檢查，
至於第二種（員工先自費，再檢據報銷）與第三種（直接給予員工現金補助或津貼）方式，因為公司沒有直接付款給醫療院所，所以就不會有第二段公司與醫療院所之間的扣繳申報議題，相對會比較單純。
四、員工健康檢查補助常見問題 FAQ
企業提供健檢補助不僅是員工福利，更是ESG社會責任的實踐。但在永續治理與稅務合規並行的趨勢中，企業仍須注意相關稅務規定，如此才能兼顧「員工健康關懷」與「稅務透明治理」，打造符合法令、兼具永續精神的企業文化。
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Q1：超出職安法範圍，另外增加的健檢次數及項目負擔，或是員工一般性定期健檢，要列報員工所得嗎？
屬於員工職務上取得之補助費，要列報為員工的薪資所得。
Q2：健檢補助由公司直接支付給醫療院所比較好，還是由員工先墊付再檢據報銷比較好？
站在公司的角度，建議是採取員工先自費墊付，再檢據報銷，在扣繳申報作業上會比較單純。
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蔡佳峻會計師
嘉威聯合會計師事務所合夥人
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🔸企業股權架構規劃，包括投資控股公司、閉鎖性公司及特別股之設計。
🔸資產傳承諮詢、遺囑內容撰擬及信託架構設計。
蔡佳峻會計師自 2012 年起加入嘉威會計師團隊，執業經驗豐富。多年來專注服務台灣中小企業，深知中小企業對「稅」的重視度。客戶行業多元，實務經驗豐富，且事務所同仁流動率低，服務人員穩定，不會因常更換帳務人員而造成客戶困擾。